实际上，根据中国法律规定，小产权房属于非法建设。因为其建设过程中常常违反了城市规划、土地利用和建设标准等法律法规，导致其无法获得合法的建设批准文件。因此，小产权房的合法性在理论上被认为是违法的。
然而，由于历史原因和实际需要，东莞等地上百万套小产权房的存在一直没有被彻底取缔。这些小产权房自建成之日起就开始交纳相关的土地使用费和房屋契税等税费，并且被当地**纳入了城市发展规划中。因此，虽然小产权房在法律上被认定为违法建筑，但在实际运作中被当作合法存在。
此外，东莞市**也采取了一系列的政策来规范小产权房的转让和交易。根据相关政策规定，小产权房可以通过二手房交易的方式进行出售，但必须满足一定的条件，如须经产权调查、建筑结构审查和土地使用费的缴纳等。这些政策的出台旨在为小产权房的合法性提供一定的保障，也为购买者提供了一定的法律依据。
然而，小产权房的合法性一直备受争议和质疑。部分人认为小产权房违反了国家土地管理制度，有损社会稳定和公平。另一些人则认为，小产权房是一种“过渡产权”，解决了一部分市民的住房问题，也有利于城市的发展和稳定。对于这个问题，尚没有一个一致的法律解释和明确的政策规定。
总而言之，东莞小产权房在法律上被认定为非法建筑，但在实际运作中被当作合法存在并且有一定的规范和管理政策。其合法性备受争议，需要通过法律和政策的进一步明确来解决。对于购买小产权房的消费者来说，应该在购买前充分了解相关政策和风险，以便做出明智的决策。
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